Московское ЯБЛОКО участвует во всех выборах, проводящихся в Москве. На каждые выборы формируется программа кандидатов, исходя из сложившихся в городе и стране условий, а также целей избирательной кампании. Избирательные программы традиционно включают оценку текущей ситуации и предложения по развитию Москвы в целом и по отдельным важнейшим направлениям: экономика, местное самоуправление, градостроительство, экология, образование, здравоохранение, малый и средний бизнес, ЖКХ, многим другим.